收到建筑业统一发票然后支付对方企业款项，应当通过“在建工程”科目以及“应交税费”相关二级科目、“应付账款”相关二级科目核算。在建工程，指企业资产的新建、改建、扩建，或技术改造、设备更新和大修理工程等尚未完工的工程支出。应交税费是指企业根据在一定时期内取得的营业收入、实现的利润等，按照现行税法规定，采用一定的计税方法计提的应交纳的各种税费。

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